Книжкові видання та компакт-диски Журнали та продовжувані видання Автореферати дисертацій Реферативна база даних Наукова періодика України Тематичний навігатор Авторитетний файл імен осіб
|
Для швидкої роботи та реалізації всіх функціональних можливостей пошукової системи використовуйте браузер "Mozilla Firefox" |
|
|
Повнотекстовий пошук
Пошуковий запит: (<.>A=Obolenskaya M$<.>) |
Загальна кількість знайдених документів : 4
Представлено документи з 1 до 4
|
1. |
Obolenskaya M. Yu. The start of systems biology in Ukraine [Електронний ресурс] / M. Yu. Obolenskaya, B. T. Tokovenko, A. V. Kuklin, A. A. Frolova, R. R. Rodriguez, V. A. Dotsenko, O. O. Dragushchenko // Biopolymers and cell. - 2014. - Vol. 30, № 1. - С. 16-24. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BPK_2014_30_1_4 Представлено наукові здобутки першої в Україні (ІМБіГ НАН України) лабораторії системної біології. Вони включають створення веб-інструменту для всегеномного пошуку сайтів зв'язування транскрипційних факторів у промоторах евкаріотних генів, розкриття тонко збалансованого механізму відповіді первинних гепатоцитів на дію інтерферону <$E alpha> в дозі, зареєстрованій на першому етапі регенерації печінки після часткової гепатектомії; розробку нового методу інференції мережі генної регуляції для його використання в середовищі ГРІД і створення стехіометричної моделі фолатного циклу у плаценті людини для характеристики поведінки системи за різних патологічних станів.
| 2. |
Dotsenko V. A. Mathematical modeling of folate-related processes in human placenta [Електронний ресурс] / V. A. Dotsenko, M. Yu. Obolenskaya // Biopolymers and cell. - 2014. - Vol. 30, № 2. - С. 149-156. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BPK_2014_30_2_11 Мета роботи - описати фолат-залежні процеси в плаценті людини за допомогою стехіометричної моделі і дослідити поведінку системи за різних умов. Модель створено на основі стехіометрії реакцій фолат-залежних процесів, що перебувають у стаціонарному стані, з використанням програми CellNetAnalyzer. Поведінку системи охарактеризовано через елементарні моди і коефіцієнти контролю за потоками залежно від активності метилентетрагідрофолат-редуктази і метіонінсинтази і надходження метіоніну. Зміна активності метилентетрагідрофолат-редуктази спричиняє зниження потоків через основні шляхи елімінації гомоцистеїну та збільшення потреби у 5-метилтетрагідрофолаті. Інактивація метіонінсинтази зменшує споживання 5-метилтетрагідрофолату і збільшує потоки через реакції синтезу таурину. Брак метіоніну призводить до зростання споживання 5-метилтетрагідрофолату, зменшення вмісту гомоцистеїну та зниження потоків через реакції метіонінового циклу. Аналіз функціонування моделі виявив відповідність змін у функціонуванні системи клінічним показникам. Але є свідоцтва того, що рівень гомоцистеїну як маркера функціонування фолатзалежних процесів є недостатнім для призначення обгрунтованої терапії.
| 3. |
Kuklin A. V. Expression of isgylation related genes in regenerating rat liver [Електронний ресурс] / A. V. Kuklin, T. A. Poliezhaieva, I. O. Zhyryakova, V. V. Ogryzko, M. Yu. Obolenskaya // Biopolymers and cell. - 2015. - Vol. 31, № 5. - С. 351-361. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BPK_2015_31_5_5 Нещодавно проведені дослідження показали, що на ранньому етапі відновлювального процесу активується синтез інтерферону alpha (IFN alpha), цитокина вродженого імунітету. Роль IFN alpha у процесі відновлення печінки поки що не з'ясовано. Мета роботи - проаналізувати експресію класичних інтерферон-стимульованих генів (ІСГ), Ube1l, Ube2l6, Trim25, Usp18 і Isg15, у печінці під час її переходу від стану спокою до проліферації у відповідь на часткову гепатектомію й під час реакції гострої фази після лапаротомії. Ці гени відповідають за посттрансляційну модифікацію білків шляхом ІСГілювання. Рівень експресії генів, які кодують 18S рРНК і транскрипційний фактор TBP, що зв'язується з TATA-боксом, використали як непрямий показник інтенсивності трансляції тв транскрипції. Концентрацію індивідуальних РНК визначали в тотальній РНК печінки за допомогою методу зворотної транскрипції і ланцюгової полімеризації в реальному часі. Часткова гепатектомія викликає поступове підвищення експресії генів Tbp і 18S rRNA впродовж 12 год після операції і зниження експресії генів ІСГілювання впродовж перших 3-х год з наступним незначним підвищенням до 12 год. Рівень Isg15 транскриптів залишався зниженим впродовж всього періоду дослідження. Встановлено, що лапаротомія викликає поступове зниження експресії генів Tbp і 18S rRNA і виражене підвищення концентрації транскриптів генів ІСГілювання на першому етапі (1 - 3 год), що змінюється різким зниженням до 6-ої год з наступним незначним підвищенням/зниженням до 12-ої год. Зміни в рівні транскриптів гена Ifn alpha і генів системи ІСГілювання носять протилежний характер на кожній зі стадій відповіді печінки на часткову гепатектомію і лапаротомію. Висновки: зроблено припущення, що експресія генів, які задіяні у процесі ІСГілювання, не залежить від експресії гена Ifn alpha. Використані "показники" активності транскрипції, трансляції і посттрансляційної модифікації білків шляхом ІСГілювання принципово відрізняються між двома реакціями відповіді печінки на часткову гепатектомію і лапаротомію, що свідчить про специфічність реакцій вродженого імунітету.
| 4. |
Obolenskaya M. Yu. Practical approach to quantification of mRNA abundance using RT-qPCR, normalization of experimental data and MIQE [Електронний ресурс] / M. Yu. Obolenskaya, A. V. Kuklin, R. R. Rodrigez, O. P. Martsenyuk, K. L. Korneyeva, V. A. Docenko, O. O. Draguschenko // Biopolymers and cell. - 2016. - Vol. 32, № 3. - С. 161-172. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BPK_2016_32_3_2 Реакція зворотної транскрипції і ланцюгової полімеризації в реальному часі (ЗТ-кПЛР) стала найбільш уживаним методом для характеристики профілів експресії індивідуальних мРНК через можливості оцінки концентрацій в широкому діапазоні, відносної швидкості реакції, чутливості, роздільності та відносно невеликої вартості. Однак, багатоступеневий характер реакції, різні реактиви, різна якість біологічних зразків і відсутність стандартних приписів для проведення реакції приховують небезпеку одержати викривлені результати. Для стандартизації кожного з етапів методу та підвищення надійності результатів проф. С. Бустіним із співробітниками [2004] було розроблено методичну інструкцію, що містила мінімальну інформацію, яка необхідна для публікації результатів, одержаних за допомогою ЗТ-кПЛР. Крім того, RDML консорціумом на основі XML (розширювана мова розмічання) створено спеціальну мову RDML і базу даних RDML для збору й аналізу результатів ЗТ-кПЛР экспериментів. Описано весь процес ЗТ-кПЛР за етапами згідно з вимогами методичної інструкції MIQE і власним досвідом авторів у застосуванні цього методу.
|
|
|